Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Gm12706-201ENSMUST00000121588 698 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm14333-201ENSMUST00000130484 264 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm12914-201ENSMUST00000148635 305 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm12065-201ENSMUST00000149592 656 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 H3f3aos-202ENSMUST00000159740 229 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm5935-202ENSMUST00000178986 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Anks1b-207ENSMUST00000182045 544 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm26960-201ENSMUST00000182263 412 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm27698-201ENSMUST00000184060 249 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm29009-201ENSMUST00000186340 496 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Olfr468-ps1-201ENSMUST00000207203 593 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm2446-201ENSMUST00000220144 772 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm7753-201ENSMUST00000221007 867 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Cenpk-201ENSMUST00000022227 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 AC192334.2-201ENSMUST00000223087 1091 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm37664-201ENSMUST00000194607 3813 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.56□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Celf2-203ENSMUST00000114923 529 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm22091-201ENSMUST00000116908 127 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm12102-201ENSMUST00000118251 604 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm13239-201ENSMUST00000119920 637 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Slc7a12-202ENSMUST00000120484 1010 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm26173-201ENSMUST00000158416 136 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm26177-201ENSMUST00000178683 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm37081-201ENSMUST00000192034 196 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 D030025E07Rik-205ENSMUST00000198478 418 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm44125-201ENSMUST00000203068 448 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC2.56□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Olfr1457-204ENSMUST00000215229 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Vmn1r66-203ENSMUST00000227719 2765 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm43016-201ENSMUST00000196628 3150 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm26247-201ENSMUST00000116702 91 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm14815-201ENSMUST00000120060 488 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm12044-201ENSMUST00000120335 213 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Sult2a-ps4-201ENSMUST00000121421 386 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm24836-201ENSMUST00000122609 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm15878-201ENSMUST00000127561 306 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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Vipas39Q8BGQ1 Igkv11-114-201ENSMUST00000200013 346 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm43732-201ENSMUST00000200260 511 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm43224-201ENSMUST00000201567 898 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm17991-201ENSMUST00000208139 297 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 AC153526.2-201ENSMUST00000218206 2031 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Vmn1r178-204ENSMUST00000226640 2282 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm4017-201ENSMUST00000084813 338 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Igkv2-109-201ENSMUST00000103322 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm14899-201ENSMUST00000118673 548 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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