Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Fam81b-201ENSMUST00000208418 2760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm16327-201ENSMUST00000137146 228 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm5963-201ENSMUST00000143451 236 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm26045-201ENSMUST00000157862 97 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm22163-201ENSMUST00000158408 135 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm24056-201ENSMUST00000158617 146 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm37421-201ENSMUST00000193088 132 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm44464-201ENSMUST00000198010 138 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm37151-201ENSMUST00000194631 5007 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Elavl4-202ENSMUST00000102723 4024 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Rtel1-205ENSMUST00000108815 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Vmn2r-ps49-201ENSMUST00000173160 3551 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Kdm4c-201ENSMUST00000030102 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm26140-201ENSMUST00000103807 110 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm14564-201ENSMUST00000122159 294 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm23098-201ENSMUST00000157552 299 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm6051-201ENSMUST00000201529 352 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm26330-201ENSMUST00000082817 104 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Nrcam-201ENSMUST00000020939 4469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Usp54-202ENSMUST00000035340 6495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Mms19-217ENSMUST00000171561 6607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm45211-201ENSMUST00000206208 2650 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Efhb-201ENSMUST00000024725 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Mdc1-201ENSMUST00000082337 7335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm32647-201ENSMUST00000206116 3288 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm37742-201ENSMUST00000193263 3979 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm26085-201ENSMUST00000157900 116 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm44650-201ENSMUST00000206929 194 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 AC122484.1-201ENSMUST00000221578 177 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm6293-201ENSMUST00000050339 195 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Snord80-201ENSMUST00000083801 81 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Adgrl2-212ENSMUST00000198779 4592 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Hoxd11P23813 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Zfp458-201ENSMUST00000045969 3488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Akr1c14-202ENSMUST00000118717 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Tfpi-203ENSMUST00000111711 3968 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm13371-201ENSMUST00000137756 469 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm15767-202ENSMUST00000153786 544 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Mir5710-201ENSMUST00000176884 69 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
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