Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Polk-205ENSMUST00000221899 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm15304-201ENSMUST00000122150 2640 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm14020-201ENSMUST00000118165 662 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm43009-201ENSMUST00000199979 3566 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Vmn1r6-203ENSMUST00000227131 8330 ntAPPRIS P2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm43320-201ENSMUST00000196047 2916 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Cyld-204ENSMUST00000209206 4032 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm17067-201ENSMUST00000166837 3673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Spata31d1c-201ENSMUST00000099427 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Olfr1382-203ENSMUST00000213707 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Olfr1382-204ENSMUST00000213899 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Olfr1382-205ENSMUST00000217564 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Igkv1-110-201ENSMUST00000103321 401 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm11912-201ENSMUST00000117235 264 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Rpl23a-ps14-201ENSMUST00000118777 424 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm11982-201ENSMUST00000121480 314 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm24674-201ENSMUST00000179194 104 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Mir7211-201ENSMUST00000184071 63 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm8719-201ENSMUST00000203602 534 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm2926-201ENSMUST00000205625 239 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm3623-201ENSMUST00000173643 2747 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm15902-202ENSMUST00000219623 3477 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Vmn2r93-201ENSMUST00000079206 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Vmn2r47-201ENSMUST00000170131 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm25764-201ENSMUST00000104092 134 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm45651-201ENSMUST00000210857 335 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm43705-201ENSMUST00000195958 3717 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
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