Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm26779-201ENSMUST00000181101 551 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm43431-201ENSMUST00000198577 340 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm44142-201ENSMUST00000203358 311 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm18540-201ENSMUST00000204025 526 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Olfr439-ps1-201ENSMUST00000204679 307 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 AC162387.1-201ENSMUST00000213369 213 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 AC150314.1-201ENSMUST00000214798 238 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 AC121286.1-201ENSMUST00000218811 380 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 CT030254.2-201ENSMUST00000225902 502 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 AC155167.3-201ENSMUST00000226349 217 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm9818-201ENSMUST00000050900 255 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm23650-201ENSMUST00000083355 70 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 AC163660.3-201ENSMUST00000224253 1563 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Depdc1a-201ENSMUST00000029825 2920 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm43300-201ENSMUST00000198540 2043 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm12492-201ENSMUST00000117665 564 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm8217-201ENSMUST00000119136 465 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm12806-201ENSMUST00000119384 268 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm25341-201ENSMUST00000157461 268 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Olfr733-201ENSMUST00000163469 994 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm21673-201ENSMUST00000186640 436 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm28641-201ENSMUST00000187783 335 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm21135-201ENSMUST00000189023 436 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm28358-202ENSMUST00000189292 223 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm45101-201ENSMUST00000208327 232 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 AC124549.2-201ENSMUST00000224243 222 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 AC166369.3-201ENSMUST00000227286 409 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Ear14-201ENSMUST00000049559 468 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Olfr1104-202ENSMUST00000214857 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Olfr811-202ENSMUST00000215058 2508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Igkv4-57-201ENSMUST00000103357 352 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Trav16-201ENSMUST00000103667 420 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm14647-201ENSMUST00000119392 680 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm6265-201ENSMUST00000149263 231 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm13853-201ENSMUST00000155496 557 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm22755-201ENSMUST00000157143 100 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm25621-201ENSMUST00000157223 114 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm25283-201ENSMUST00000157272 77 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm26870-201ENSMUST00000181242 1170 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm27226-201ENSMUST00000184676 511 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm29192-201ENSMUST00000190942 377 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 2810432F15Rik-201ENSMUST00000198632 657 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Tas2r123-201ENSMUST00000071696 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm5239-201ENSMUST00000081864 369 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm37598-201ENSMUST00000194506 1301 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Olfr267-202ENSMUST00000216719 4050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Olfr652-202ENSMUST00000215410 4672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm42909-201ENSMUST00000196982 3619 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Olfr747-204ENSMUST00000213238 1416 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Krtap24-1-201ENSMUST00000052512 1571 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Serpina7-201ENSMUST00000033626 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Ifi203-ps-201ENSMUST00000155076 2556 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Tfpi-204ENSMUST00000111714 3614 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 AC132237.1-201ENSMUST00000220950 4475 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Ssxb8-201ENSMUST00000101690 518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm25407-201ENSMUST00000104102 134 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Mir1198-201ENSMUST00000116995 121 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm7916-201ENSMUST00000120325 456 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm13443-201ENSMUST00000120770 555 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 n-R5s32-201ENSMUST00000122495 103 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm24061-201ENSMUST00000157489 120 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm22108-201ENSMUST00000177961 106 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm24798-201ENSMUST00000179334 106 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm23186-201ENSMUST00000180078 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gtpbp4-ps4-201ENSMUST00000184813 258 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Mir7062-201ENSMUST00000185038 66 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm31752-201ENSMUST00000199456 856 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm5322-201ENSMUST00000206142 699 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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