Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Olfr869-201ENSMUST00000213024 1783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm24469-201ENSMUST00000104487 131 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Rps12-ps26-201ENSMUST00000117751 333 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Rps15a-ps4-201ENSMUST00000119415 392 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm22966-201ENSMUST00000157957 129 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm15796-201ENSMUST00000162135 204 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm5258-201ENSMUST00000165437 327 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm26683-201ENSMUST00000181737 470 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Scgb2b16-ps-201ENSMUST00000188720 333 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 1700121L16Rik-201ENSMUST00000189166 561 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Ighv15-1-201ENSMUST00000194450 276 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm35386-201ENSMUST00000204603 629 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm17779-201ENSMUST00000213395 394 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm9174-201ENSMUST00000078149 255 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Fign-203ENSMUST00000131615 9734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm38106-201ENSMUST00000194107 2534 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Olfr1197-202ENSMUST00000213118 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm26081-201ENSMUST00000104068 132 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm12683-201ENSMUST00000117528 415 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Rps15a-ps3-201ENSMUST00000121072 395 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm23184-201ENSMUST00000122594 131 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm24636-201ENSMUST00000158673 288 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm7909-201ENSMUST00000182688 614 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Mir6943-201ENSMUST00000185186 66 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 1700024B18Rik-201ENSMUST00000190088 423 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm7726-201ENSMUST00000206241 231 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 4930431P19Rik-201ENSMUST00000207570 451 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Fabp9-201ENSMUST00000029038 583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 B3galt1-202ENSMUST00000112346 4977 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Vmn2r7-202ENSMUST00000161972 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Cnot7-203ENSMUST00000132032 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm37900-201ENSMUST00000195510 3805 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Pign-205ENSMUST00000186485 6759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 BC051076-202ENSMUST00000199477 2868 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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Sh3bp2Q06649 Gm37006-201ENSMUST00000195253 2674 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Vmn1r6-205ENSMUST00000227631 7805 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Olfr1484-203ENSMUST00000215567 3699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp2Q06649 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp2Q06649 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp2Q06649 Gm10964-201ENSMUST00000106852 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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Sh3bp2Q06649 Gm38832-201ENSMUST00000205674 400 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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Sh3bp2Q06649 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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Sh3bp2Q06649 Cp-203ENSMUST00000108325 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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Sh3bp2Q06649 Olfr32-204ENSMUST00000215153 3117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp2Q06649 Gm37588-201ENSMUST00000195024 2496 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp2Q06649 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp2Q06649 Gm32061-201ENSMUST00000207232 3478 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp2Q06649 Olfr107-205ENSMUST00000216844 4021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp2Q06649 Gm24951-201ENSMUST00000102182 109 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp2Q06649 Traj50-201ENSMUST00000103693 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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Sh3bp2Q06649 Gm15752-201ENSMUST00000117427 394 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp2Q06649 Gm14878-201ENSMUST00000118167 293 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp2Q06649 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp2Q06649 Gm25637-201ENSMUST00000157529 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp2Q06649 Mir1947-201ENSMUST00000158235 85 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp2Q06649 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp2Q06649 Gm26195-201ENSMUST00000175035 101 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp2Q06649 Gm16404-201ENSMUST00000177739 468 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp2Q06649 Gm6660-201ENSMUST00000179149 468 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp2Q06649 Gm14598-201ENSMUST00000180109 468 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp2Q06649 Gm14625-201ENSMUST00000180231 468 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms