Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm38832-201ENSMUST00000205674 400 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm17811-201ENSMUST00000206193 387 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PtpreP49446 4930431P19Rik-201ENSMUST00000207570 451 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PtpreP49446 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Znrd1as-201ENSMUST00000040177 976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm22806-201ENSMUST00000082738 136 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm22353-201ENSMUST00000083918 136 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Olfr1300-ps1-201ENSMUST00000208175 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Vmn1r30-205ENSMUST00000228635 1776 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm45066-201ENSMUST00000207528 2551 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Zfp426-213ENSMUST00000169558 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm44535-201ENSMUST00000208889 3136 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Vmn1r195-202ENSMUST00000228711 3056 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Defa-ps15-201ENSMUST00000118178 477 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm13737-201ENSMUST00000119793 232 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm11325-201ENSMUST00000119967 469 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm13787-201ENSMUST00000120422 168 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm13132-201ENSMUST00000121194 472 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm13096-201ENSMUST00000127752 251 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm5963-201ENSMUST00000143451 236 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm15461-201ENSMUST00000143488 235 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm24931-201ENSMUST00000158324 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm5258-201ENSMUST00000165437 327 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm22367-201ENSMUST00000178930 132 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm27805-201ENSMUST00000184513 79 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm27760-201ENSMUST00000185048 114 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Rhoay-ps3-201ENSMUST00000187648 576 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 1700024B18Rik-201ENSMUST00000190088 423 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm9174-201ENSMUST00000078149 255 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm23928-201ENSMUST00000082469 145 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm43329-201ENSMUST00000200120 3232 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Vmn1r34-205ENSMUST00000227332 3075 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm15261-201ENSMUST00000136779 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Olfr1152-202ENSMUST00000213308 6201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Slfn10-ps-201ENSMUST00000100716 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm29221-201ENSMUST00000186092 2894 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Abca16-202ENSMUST00000120490 5088 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Usp46-201ENSMUST00000068058 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Vmn1r178-204ENSMUST00000226640 2282 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Slc22a22-201ENSMUST00000022995 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 AC115970.1-201ENSMUST00000218910 1758 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 2210408F21Rik-206ENSMUST00000138653 417 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 4930406D18Rik-202ENSMUST00000152827 657 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm23905-201ENSMUST00000157568 109 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm25224-201ENSMUST00000158195 68 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm22611-201ENSMUST00000158288 150 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm29320-201ENSMUST00000185235 615 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm28339-201ENSMUST00000185845 696 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm28471-201ENSMUST00000185994 615 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm29179-202ENSMUST00000186138 615 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm29574-201ENSMUST00000186226 696 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm28598-201ENSMUST00000186490 615 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm28057-201ENSMUST00000186603 615 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm29448-201ENSMUST00000186675 615 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm29314-201ENSMUST00000186800 615 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm28253-202ENSMUST00000187971 615 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm28896-201ENSMUST00000188609 696 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm29268-201ENSMUST00000188669 615 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 2610044O15Rik8-203ENSMUST00000188757 413 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm29169-201ENSMUST00000189835 615 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm37172-201ENSMUST00000191926 615 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm38107-201ENSMUST00000194873 696 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Hcfc1r1-ps2-201ENSMUST00000199379 339 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm45553-201ENSMUST00000209929 507 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Defb14-201ENSMUST00000052601 204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm24762-201ENSMUST00000083689 104 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm10337-201ENSMUST00000096145 165 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PtpreP49446 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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