Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Klrc2-204ENSMUST00000119533 717 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm15037-201ENSMUST00000120358 259 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm13406-201ENSMUST00000121991 256 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm24720-201ENSMUST00000157518 166 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm26348-201ENSMUST00000157528 240 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm23473-201ENSMUST00000158883 116 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm10075-201ENSMUST00000162030 545 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm22631-201ENSMUST00000179656 94 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm26871-205ENSMUST00000181926 742 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm37402-201ENSMUST00000194525 5000 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Igkv9-128-201ENSMUST00000196602 353 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm9379-201ENSMUST00000196790 646 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm29926-201ENSMUST00000201443 660 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 AL669916.3-201ENSMUST00000213855 94 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 AL669916.4-201ENSMUST00000215976 94 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 AC152979.1-201ENSMUST00000218214 289 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 AC115750.1-201ENSMUST00000220441 567 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm35558-203ENSMUST00000222264 204 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 CT030238.4-201ENSMUST00000228579 801 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Olfr235-201ENSMUST00000073507 1079 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Olfr1048-201ENSMUST00000099900 963 ntAPPRIS P2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Olfr597-202ENSMUST00000216456 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm37645-201ENSMUST00000194285 3556 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Mcmdc2-203ENSMUST00000125294 2003 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm37848-201ENSMUST00000195288 3103 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Trav16n-201ENSMUST00000103633 353 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 n-R5s32-201ENSMUST00000122495 103 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 A630050E04Rik-201ENSMUST00000151443 581 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm24914-201ENSMUST00000157285 313 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm23380-201ENSMUST00000158448 103 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm16569-201ENSMUST00000160526 314 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm26701-201ENSMUST00000181571 234 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm27028-201ENSMUST00000182303 399 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm43067-201ENSMUST00000201580 445 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm44941-201ENSMUST00000204216 627 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm45380-201ENSMUST00000210465 315 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Olfr953-ps1-201ENSMUST00000214463 892 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 AC144628.2-201ENSMUST00000227374 352 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Olfr138-201ENSMUST00000071871 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Olfr895-201ENSMUST00000093864 951 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Olfr652-203ENSMUST00000216131 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm42448-201ENSMUST00000197122 2644 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn4O35054 Gm42870-201ENSMUST00000199355 3470 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn4O35054 Zfp273-203ENSMUST00000181391 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn4O35054 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn4O35054 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn4O35054 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn4O35054 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn4O35054 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn4O35054 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn4O35054 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn4O35054 Gm22851-201ENSMUST00000178741 94 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn4O35054 Gm25074-201ENSMUST00000178782 94 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn4O35054 Mir6917-201ENSMUST00000184111 61 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn4O35054 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn4O35054 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn4O35054 Gm37658-201ENSMUST00000192672 315 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn4O35054 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn4O35054 Gm19244-201ENSMUST00000204340 253 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn4O35054 Olfr1430-ps1-201ENSMUST00000207422 917 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn4O35054 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn4O35054 AC131029.2-202ENSMUST00000228430 496 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn4O35054 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn4O35054 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn4O35054 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn4O35054 Olfr1313-203ENSMUST00000216071 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn4O35054 Ms4a14-201ENSMUST00000187467 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms