Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP8

Vmn1r10, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r10W4VSP8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r10W4VSP8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms