Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Krt27Q9Z320 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Krt27Q9Z320 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt27Q9Z320 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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