Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mbd1Q9Z2E2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms