Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip6Q9Z1Y4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms