Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cog1Q9Z160 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms