Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms