Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb6Q9Z0T9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms