Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E2

Chrd, Chordin, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrdQ9Z0E2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ChrdQ9Z0E2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChrdQ9Z0E2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChrdQ9Z0E2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChrdQ9Z0E2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChrdQ9Z0E2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChrdQ9Z0E2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ChrdQ9Z0E2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChrdQ9Z0E2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChrdQ9Z0E2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChrdQ9Z0E2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChrdQ9Z0E2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChrdQ9Z0E2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChrdQ9Z0E2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChrdQ9Z0E2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChrdQ9Z0E2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChrdQ9Z0E2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChrdQ9Z0E2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChrdQ9Z0E2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChrdQ9Z0E2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChrdQ9Z0E2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ChrdQ9Z0E2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ChrdQ9Z0E2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChrdQ9Z0E2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChrdQ9Z0E2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChrdQ9Z0E2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChrdQ9Z0E2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChrdQ9Z0E2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChrdQ9Z0E2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChrdQ9Z0E2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChrdQ9Z0E2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChrdQ9Z0E2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChrdQ9Z0E2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms