Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms