Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn3Q9WUK7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms