Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms