Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms