Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Lemd3Q9WU40 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lemd3Q9WU40 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lemd3Q9WU40 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lemd3Q9WU40 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lemd3Q9WU40 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lemd3Q9WU40 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lemd3Q9WU40 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lemd3Q9WU40 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lemd3Q9WU40 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lemd3Q9WU40 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lemd3Q9WU40 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lemd3Q9WU40 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lemd3Q9WU40 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lemd3Q9WU40 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lemd3Q9WU40 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
Lemd3Q9WU40 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lemd3Q9WU40 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lemd3Q9WU40 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lemd3Q9WU40 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lemd3Q9WU40 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lemd3Q9WU40 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lemd3Q9WU40 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lemd3Q9WU40 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lemd3Q9WU40 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lemd3Q9WU40 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lemd3Q9WU40 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms