Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Skp1Q9WTX5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skp1Q9WTX5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skp1Q9WTX5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skp1Q9WTX5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skp1Q9WTX5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skp1Q9WTX5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skp1Q9WTX5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skp1Q9WTX5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms