Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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