Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema6cQ9WTM3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6cQ9WTM3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms