Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam50bQ9WTJ8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms