Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms