Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Znf346Q9R0B7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms