Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nek3Q9R0A5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nek3Q9R0A5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nek3Q9R0A5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nek3Q9R0A5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nek3Q9R0A5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nek3Q9R0A5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nek3Q9R0A5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nek3Q9R0A5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nek3Q9R0A5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nek3Q9R0A5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nek3Q9R0A5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Nek3Q9R0A5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nek3Q9R0A5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Nek3Q9R0A5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Nek3Q9R0A5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nek3Q9R0A5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nek3Q9R0A5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nek3Q9R0A5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nek3Q9R0A5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nek3Q9R0A5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nek3Q9R0A5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nek3Q9R0A5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nek3Q9R0A5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nek3Q9R0A5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nek3Q9R0A5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nek3Q9R0A5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nek3Q9R0A5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nek3Q9R0A5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nek3Q9R0A5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek3Q9R0A5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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