Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Npas3Q9QZQ0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Npas3Q9QZQ0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms