Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms