Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChmlQ9QZD5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms