Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vps29Q9QZ88 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms