Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnnt3Q9QZ47 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms