Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms