Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms