Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT9

Znf354b, Zinc finger protein 354B, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354bQ9QXT9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf354bQ9QXT9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms