Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms