Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX66

Dpf1, Zinc finger protein neuro-d4, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf1Q9QX66 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dpf1Q9QX66 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dpf1Q9QX66 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms