Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tcea2Q9QVN7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms