Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms