Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln8Q9QUK3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms