Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms