Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Rabgef1Q9JM13 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Rabgef1Q9JM13 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Rabgef1Q9JM13 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Rabgef1Q9JM13 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rabgef1Q9JM13 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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