Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cul3Q9JLV5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul3Q9JLV5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms