Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Higd1aQ9JLR9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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