Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms