Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
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Tmod4Q9JLH8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmod4Q9JLH8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmod4Q9JLH8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmod4Q9JLH8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmod4Q9JLH8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmod4Q9JLH8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmod4Q9JLH8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmod4Q9JLH8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmod4Q9JLH8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmod4Q9JLH8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmod4Q9JLH8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmod4Q9JLH8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmod4Q9JLH8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms