Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms