Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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