Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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