Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms